粪肥腐熟好再施用。粪肥养分含量高、肥效期长，自大棚蔬菜兴起以来，一直是底肥首选，用量巨大。然而粪肥虽好，却也有其缺点，最普遍的就是粪肥不腐熟，导致烧根、熏苗等。提醒菜农，粪肥尤其是未腐熟的生粪，是不能大量施用的。冬季蔬菜换茬时间紧、任务重，通过合理的手段，粪肥可以在短时间内完成腐熟。一般来说，粪肥每10~15厘米喷洒一次腐熟剂，建成高1米左右的粪堆，然后用水浸湿，覆盖薄膜保温发酵。间隔4~7天，待粪堆发热出现蒸汽时，及时翻堆，确保腐熟均匀。经过10-15天，粪堆腐熟即可基本完成，可放心使用。腐熟彻底的粪肥一般颜色较深，呈黑褐色，臭味较淡。
　　若无法完成粪肥腐熟，建议菜农选择已经完成发酵的商品有机肥、粪肥施入棚后，不要急于定植蔬菜，应先浇一遍水，然后闭棚提温。浇水后，若棚内没有氨味，墒情合适时，就可以定植蔬菜了。蔬菜定植初期，要注意通风，尤其是夜间，也要尽量将放风口留下一道小缝以免氨气等有害气体在棚内积累。
　　肥料搭配要合理。有机肥的施用量要足。据了解，多数棚户有机肥的用量普遍不足。建议每亩有机肥的用量要达到万斤左右，可选择优质的禽畜粪肥、稻壳粪、优质秸秆等，当然也可以采取农家肥与商品有机肥混合使用的办法。
　　加入适量的化学肥料。为了保证底肥能充足的供应蔬菜整个生育期生长的营养，底肥中常采取有机肥混加化学肥料的方法。通常把所需磷肥的100%、钾肥的20%-50%、氮肥的30%-50%混入有机肥中一并施入。化肥的用量要根据所使用有机肥的质量和数量做相应的调整。
　　有机肥与生物菌肥配合施用。生物菌肥含有大量的有益菌，能够抑制病原菌侵染，促进自毒物质分解，减轻重茬为害，而足量的有机肥可保证有益菌的增殖，增殖的同时一方面可以疏松土壤，另一方面在分解土壤被固定的营养元素的同时，也会产生一些促进根系生长的物质，对蔬菜根系的生长十分有利。这样配合施用可使二者充分发挥自身的作用，达到更佳的效果。
　　使用有效的中微量元素。通常情况下，底肥中需要施入的微量元素为钙肥、硼肥以及铁锌肥料等。在施用中微肥的时候需要注意，要购买使用有效的肥料产品。