如果确定想换茬，建议及早清园。有些菜农认为苗子来了再清园即可，不必过早，这种做法不提倡。因为，晚清园会为病原菌繁殖越冬创造条件，增加棚室中的病原菌基数。建议上茬蔬菜拉秧后，尽早清园，可以让地力更好地恢复，有利于下茬蔬菜的生长。冬春季换茬时，很多菜农图省事，清园时只是将蔬菜植株茎蔓清理出去，部分残叶和大量根系都留在土壤中，尤其是在拔除瓜类蔬菜时，很多菜农直接将其从茎基部割断，将根系完全留在土壤中。蔬菜拔园若除根不彻底，会留下大量病原菌、线虫、害虫等，为以后病虫害的传播留下源头。尤其是很多棚里蔬菜植株患有根部病害，如枯萎病、根腐病、根结线虫等，若不将根完全拔出来，病原会滞留在土壤中，继续为害下茬蔬菜。
　　当前棚室病虫害发生呈上升趋势，这些病害的病原菌和虫卵多是在土壤中完成越冬越夏。棚室中发生最为严重的三大虫害是蓟马、粉虱、螨虫。拔棚后，螨虫等虫害多在土壤中藏匿或者产卵休眠，成虫、卵等落到地面上或进入土壤中，土壤中残留的植株残体为其生存提供了极大的便利。蔬菜上经常发生、危害比较严重的有50余种，而绝大多数病害都可以通过土壤传播，病原菌依靠土壤中的病残体生存，下一茬蔬菜种植时，这就是病害的初侵染源。因此拔园时建议留下10~20厘米的茎秆，先将棵子、地膜、杂草等全部清理干净，然后立即用铁锹等挖出根系，收集后带出棚外深埋。根系清理不可拖延时间过长，以免部分根系腐烂后留在土壤中。之后再利用药剂熏蒸，最大限度地杀灭病原，尤其是已有死棵、根结线虫等发生的地方，要重点处理，将病虫基数降到最小，减轻对下一茬蔬菜的威胁。
　　蔬菜拔园时，正是减少根结线虫等病原数量的大好时机，可利用此机会将附在根系的根结线虫等彻底带出来。拔园时若土壤较为干旱，可在拔园前轻浇一水，将土壤湿润，必要时可用铁锹挖除，以免须根断留在土壤中。尤其是秋茬和早春茬蔬菜种植同一品种时，更要特别注意清理干净棚内蔬菜残体，以免留下更多的自毒物质和病原，加重下茬蔬菜病虫害发生几率。
　　冬季蔬菜换茬，多数菜农都是将种植行清理一下，没有植株残体和杂草就立即翻地起垄，定植下一茬。然而，在大棚前脸、后墙等部位，还存在大量的杂草、蔬菜等，如很多菜农大棚前脸定植韭菜、蒜苗、草莓等。多年生的杂草、蔬菜，是很多病虫害尤其是病毒病传播的主要源头。仔细观察棚内蔬菜、杂草，可以在上面发现白粉病、灰霉病、粉虱、蓟马等多种病虫害存在。而韭菜等多年生作物，被病毒侵染后虽然并不表现发病症状，但其体内带毒，容易成为病毒病传播的源头。建议菜农换茬时一定要做好棚室的全面清理工作，将大棚前脸和后墙处的蔬菜、杂草一块清除。大棚前脸处最好覆盖黑色地膜，避免杂草再次长出。